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Thèse débutée le 1er novembre 2018, soutenue le 4 juillet 2022
Financement : Région Bretagne - INRA
Encadrants : Maria Manzanares-Dauleux, Antoine Gravot

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Résumé : 

Le métabolisme spécialisé joue un rôle essentiel dans les interactions plante-environnement. Sa caractérisation chez les plantes cultivées représente un enjeu scientifique important. Au cours de ma thèse, j’ai travaillé à la caractérisation du métabolisme spécialisé et de ses déterminants génétiques chez Brassica napus, et j’ai étudié sa régulation en réponse à l’infection par Leptosphaeria maculans, agent causal du phoma. J’ai contribué au développement d’une méthode de profilage métabolique ciblé et identifié 36 glucosinolates (GLSs) foliaires/racinaires, 32 composés phénoliques (PHLs) foliaires et 18 composés racinaires non documentés jusqu'à présent. La quantification des ces SMs dans 304 accessions de Brassica a permis de révéler des contrastes phytochimiques importants au sein du panel. L’analyse GWAS de ces variations phytochimiques a identifié 104 locus (QTLs). L’architecture génétique ainsi mise en évidence suggère un contrôle indépendant des sous-catégories de GLSs, PHLs et des nouveaux composés racinaires. Ces travaux fournissent une ressource utile pour l'écologie chimique et la sélection des Brassicas. En utilisant la même méthode de profilage ciblé, nous avons montré une induction des GLSs indoliques 14 jours après inoculation de la tige de B. napus par L. maculans. L'imagerie par spectrométrie de masse de la section transversale de tige de colza infectée a permis de révéler une spatialisation des réponses métaboliques suite à l’infection par L. maculans.

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