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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Génétique & Génomique

Thèmes de l'équipe Génétique et Génomique

Contexte et ambition

Les ressources alimentaires pour l’élevage devenant de plus en plus limitées et objet de concurrence, tout particulièrement avec l’alimentation humaine, l’efficacité alimentaire et les capacités d’adaptation des animaux à des conditions d’alimentation changeantes sont aujourd’hui primordiales. Il est bien établi que ces caractères, jusqu’alors peu « travaillés » par la sélection, sont ceux sur lesquels les retombées potentielles de la sélection génomique seront les plus importantes. Le phénotypage fin et le génotypage à haut débit permettent aujourd’hui de les analyser dans toute leur complexité.

Dans ce contexte, notre ambition est de décrire l’architecture génétique des caractères liés à la constitution et à la mobilisation des réserves énergétiques chez les volailles (poulet et canard) et en particulier au métabolisme des lipides. Nos travaux visent notamment l’amélioration des modèles additifs de prédiction de la valeur génétique des reproducteurs par la prise en compte d’effets d’interaction gènes-gènes ou gènes-environnement. Trois voies d’analyse complémentaires sont mises en œuvre dans une démarche intégrative : l’étude des zones chromosomiques affectant les caractères ; l’étude de l’expression génique au niveau des ARN ; l’exploitation des connaissances disponibles sur les génomes.

Objectifs

  • Cartographier les gènes influençant le stockage, la mobilisation et l’utilisation des réserves énergétiques chez les volailles
  • Analyser la régulation génétique du métabolisme des lipides
  • Participer au développement et à la mise au point des méthodes et outils nécessaires pour atteindre ces objectifs

Expertises et compétences

L’équipe Génétique & Génomique possède une expertise dans les différentes disciplines utiles à l’analyse de la variabilité génétique des caractères : la génétique, quantitative et cellulaire, la biologie moléculaire, la statistique, la bioinformatique et le développement logiciel.

Compétences méthodologiques
  • Cartographie de QTL
  • Analyse du transcriptome et de sa dynamique
  • Modélisation des réseaux de gènes
  • Analyse fonctionnelle du métabolisme des lipides
  • Validation cellulaire des effets de polymorphismes génomiques

L'équipe

Membres de l'équipe Génétique et génomique
Pascale Le Roy, responsable de l'équipe Génétique & Génomique
Pascale Le Roy

Responsable équipe "Génétique et génomique"

Tél. : 02 23 48 59 61
Courriel : Pascale Le Roy

Scientifiques

Sophie Allais
Nicolas Bédère
Colette Désert
Christian Diot
Jean-Marc Fraslin
Frédéric Hérault
Sandrine Lagarrigue
Lætitia Lagoutte
Frédéric Lecerf
Pascale Le Roy

Technicien·ne·s 

Morgane Boutin

Doctorant·e·s

Florian Herry (sujet de thèse)
Frédéric Jehl (sujet de thèse)
Kévin Muret (sujet de thèse)
David Picard-Druet (sujet de thèse)

Ils sont passés par l'équipe
Olivier Demeure
Olivier Filangi
Hélène Romé (thèse soutenue en 2015)
Pierre-François Roux (thèse soutenue en 2014)
Chaker Sbai

SPACER