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Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR 950 INRA UCBN : Laboratoire d'Ecophysiologie Végétale, Agronomie & nutritions N.C.S.

Jean-Bernard Cliquet

JB

Courriel :jean-bernard.cliquet@unicaen.fr 

Téléphone principal : 02 31 56 53 03

Équipe de recherche : Ecologie des Prairies

Profil : Maître de conférences
 

Localisation : CAMPUS 1, Bât. J3, Porte IR 066 

Adresse : Esplanade de la paix B.P 5186 14032 CAEN CEDEX 5.

 

1)     Activités de recherche :

 

 

Mes activités de recherche développées au sein de l’équipe d’écologie des prairies ont permis notamment

  • De préciser les voies de transfert d’azote entre plantes prairiales. Il est établi depuis longtemps que les Fabacées telles que le trèfle blanc jouent un rôle moteur dans les prairies par leur capacité à fixer l’azote atmosphérique et le transférer vers les plantes compagnes. Nous avons montré dans le cadre des thèses de Florence Paynel et Fabien Lesuffleur que ce transfert pouvait se faire via l’exsudation de molécules azotées, ammonium et acides aminés en particulier. Ces molécules exsudées  par la Fabacée peuvent provenir directement de la fixation symbiotique et sont ensuite réabsorbées par les Poacées compagnes telles que le ray-grass.
  • De mieux comprendre la sensibilité des Fabacées à l’oligotrophisation en soufre des prairies. Nous avons montré dans le cadre de la thèse de Sebastien Varin co-encadrée avec Servane Lemauviel que l’oligotrophisation en soufre altère la capacité du trèfle blanc à fixer l’azote atmosphérique en réduisant d’une part la formation des nodosités fixatrices et d’autre part la synthèse des protéines des nodosités, nitrogénase en particulier.
  • De montrer, grâce à la mise au point d’une méthode de dilution isotopique du 34SO4 de la solution nutritive par le S atmosphérique que les plantes prairiales peuvent utiliser le S pédosphérique et le S atmosphérique pour leur croissance. Elles peuvent augmenter leur capacité foliaire d’utilisation du soufre atmosphérique et leur longueur spécifique racinaire en cas d’appauvrissement du milieu en S. Nous recherchons actuellement quelles  sont les espèces les plus sensibles à cette oligotrophisation par l’évaluation de leurs teneurs critiques en soufre.

Par ailleurs, je développe depuis l’an dernier deux nouveaux projets de recherche

  • Le premier concerne l’influence des couverts végétaux prairiaux sur les communautés microbiennes impliquées dans le cycle de l’azote et du soufre du sol. Ce projet associe des écologues, physiologistes et microbiologistes de notre équipe et de UMR 1121 Nancy-Colmar Agronomie et Environnement dans le cadre d’un programme « pari scientifique » du département EA de l’INRA. Il vise à relier la diversité fonctionnelle des végétaux à celle des micro-organismes du sol.
  • Le second concerne la thèse de Caroline Kohler qui s’intéresse à la capacité des plantes prairiales à stocker du carbone dans les organes végétaux mais également dans les sols prairiaux. Cette thèse, financée par le conseil régional Basse-Normandie est dirigée par A. Bertrand, S Lemauviel et moi-même a débutée en novembre 2011 et fait l’objet d’une collaboration avec le domaine expérimentale INRA du pin, dans l’Orne.

Activités contractuelles associées

  • Pari scientifique « Influence d’une diversification fonctionnelle des couverts végétaux sur la diversité fonctionnelle des communautés microbiennes jouant un rôle dans la fertilité N/S des sols », 2011-2012, responsable Sophie Slezack-Deschaumes.

2)     Dernières publications

Varin S., Lemauviel-Lavenant S., Cliquet J.B. 2013. Is white clover able to switch to atmospheric sulphur sources when sulphate availability decreases? Journal of Experimental Botany 64: 2511-2521.

Lesuffleur F., S., Cliquet J.B. 2010.  Characterisation of root amino acid exudation in white clover. Plant Soil, 333, 191-201.

Varin S., Cliquet J.B. Personeni E., Avice J.C., 2010. Lemauviel-Lavenant S., 2010. How does sulfur availabilty modify N acquisition of white clover (Trifolium repens L.) J Exp. Bot., 61: 225-234.

Fustec J., Lesuffleur F., Mahieu S. Cliquet J.B., 2010. Nitrogen rhizodeposition of legumes. A review Agron. Sustain. Dev. 30: 57-66.

Lee B.R., Jung W.J., Avice J.C., Cliquet J.B., Ourry A., Kopriva S., Kim T.H., 2009. Increase of proline loading to phloem and its effect on nitrogen uptake and assimilation in water-stressed white clover. New Phytol. 182:654-663.

Tallec T., Diquélou S., Lemauviel-Lavenant S. , Cliquet J.B.,  Lesuffleur F., Ourry A., 2009. Availability of N and S affect nutrient acquisition efficiencies differently by Trifolium repens and Lolium perenne when grown in monoculture or in mixture. Environ. Exp. Bot. 66, 309-316.

Varin S., Leveel, B., Lemauviel-Lavenant S., Cliquet J.B., 2009. Does the white clover response to sulphur availability correspond tophenotypic or ontogenetic plasticity? Acta Oecologica, 35, 452-457.

Varin S., Lemauviel-Lavenant S., Cliquet J.B. Diquélou S., Michaelson-Yates T.M., 2009. Functinal plasticity of Trifolium repens L. in response to sulphur and nitrogen availability. Plant Soil, 317, 189-200.

Limami A.M., Glevarec G., Ricoult C., Cliquet J.B., Planchet E. 2008 Concerted modulation of alanine and glutamate metabolism in young Medicago truncatula seedlings under hypoxic stress. J Exp. Bot. 59, 2325-2335.

Paynel F., Lesuffleur F., Bigot J., Diquelou S., Cliquet J.B. 2008. A study of 15N transfer between legumes and grasses. Agron. Sustain. Dev. 28, 281-290.

Tallec T., Diquélou S., Lemauviel-Lavenant S., Cliquet J.B.,  Lesuffleur F., Ourry A. 2008. Nitrogen:sulphur ratio alters competition between Trifolium repens and Lolium perenne under cutting: Production and competitive abilities. Eur. J. Agronomy. 29, 94-101.

Lesuffleur F., Paynel F., Bataillé M.P., Le Deunff E, Cliquet J.B. 2007. High proportions of glycine and serine in root exudates of six different species result from high efflux rates. Plant Soil 294, 235-246.

Vandenkoornhuyse P., Mahé S., Ineson P. Staddon P., Ostle N., Cliquet J.B., Francez A.J., Fitter A.H., Young P.W., 2007. Active root-inhabiting microbes identified by rapid incorporation of plant-derived carbon into RNA. P.N.A.S. 104, 16970-16975. 

 

3)       Encadrement doctoral

 

  • Co-encadrement de la thèse de C. Kohler (2011-2014) (Bourse de la région Basse Normandie) : « Contribution des espèces végétales au stockage du carbone dans les prairies de Basse-Normandie. »
  • Co-encadrement de la thèse de S. Varin (2005- mars 2009) (Bourse MRT) : « Réponse fonctionnelle du trèfle blanc face à des nutritions soufrées et azotées variables, implications dans la dynamique des communautés végétales des prairies. »

4)       Activités d'enseignement

  • 1 service complet: 192h/an. Discipline : Physiologie végétale, Ecophysiologie, Techniques de laboratoire. (L1, L2, Master R/P EcoBioValo, Ecocaen)
  • Responsable de 3 modules (L1, L2, M1).

5)       Autres activités

  • Animateur de l’équipe d’écologie des prairies.
  • Coanimateur des séminaires réflexives de l’INRA (2005-2010).
  • Membre nommé puis élu du Conseil National des Universités en section 66 physiologie (1999-2008).
  • Reviewer pour de nombreuses revues (Plant & Soil, New Phytologist, Soil Biology & Biochemistry..)